De medische registers en persoonlijke dossiers behoren tot de directe geschiedenis van de instelling. Vanaf het ontstaan van de psychiatrie werden rudimentaire registers bijgehouden. In het begin werd summier melding gemaakt van wie er onderdak kreeg, later werden ze op aangeven van Jozef Guislain aangevuld met meer informatie.

De registers zijn ook de meest duidelijke illustratie van het ontstaan van de psychiatrische zorg in Gent, en bij uitbreiding België. Het merendeel van de registers uit het Hospice Guislain zijn bewaard gebleven. Ook een deel van de persoonlijke patiëntendossiers (met voornamelijk juridische en wettelijke correspondentie) is nog aanwezig.